Программой предусмотрена трансформация отношений собственности на железнодорожном транспорте. Имущество федерального железнодорожного транспорта передается единому хозяйствующему субъекту - открытому акционерному обществу «Российские железные дороги». Ранее действовавшие федеральные законы в области функционирования железнодорожного транспорта были ориентированы на федеральную собственность имущества железнодорожного транспорта, поэтому их положения потребовали концептуального пересмотра. Аналогичного пересмотра потребовали положения законов, касающиеся организационноправовой формы предприятий отрасли. В соответствии с Программой происходит изменение существа правоотношений, связанных с организацией и обеспечением перевозочного процесса. Прежде всего, перевозочный процесс, осуществляемый железными дорогами в рамках единой операции, разделяется на два самостоятельных направления правоотношений - услуги инфраструктуры и перевозки. Программой также поставлена задача обеспечить становление и развитие конкурентной среды в сфере железнодорожных перевозок, возможности функционирования независимых перевозчиков на железнодорожном транспорте. Потребовалась полная переработка прежних законов с учетом экономических, организационных и правовых изменений в структуре отрасли, предусмотренных Программой, а также вновь появляющихся субъектов рынка железнодорожных перевозок. В качестве одной из первоочередных задач реформирования железнодорожного транспорта в целях развития конкуренции в отрасли Программой определено разделение в сфере полномочий МПС России функций государственного регулирования и функций организации хозяйственной деятельности организаций железнодорожного транспорта, причем последние функции предусматривается передать в компетенцию самих хозяйствующих субъектов без государственного вмешательства. Поскольку ранее действовавшими федеральными законами по вопросам функционирования железнодорожного транспорта закреплялся ряд полномочий МПС России, касающихся организации хозяйственной деятельности, в данной части эти законы потребовали существенного пересмотра и концептуально нового изложения.