Проезд пассажиров на железнодорожном транспорте, в том числе и в пригородном сообщении, согласно статье 14 Федерального закона, во всех случаях должен осуществляться по проездным документам (билетам). Это касается, в том числе, и пассажиров, которым в соответствии с законодательством Российской Федерации предоставлены льготы по проезду (военнослужащих, работников всех правоохранительных органов и иных категорий граждан). Для проезда указанные категории граждан должны получить в билетной кассе соответствующий бесплатный проездной документ (билет) и только потом садиться в поезд. Проезд по удостоверению при отсутствии полученного билета считается безбилетным проездом, за что налагается штраф, предусмотренный административным законодательством Российской Федерации. Данная норма предусмотрена в целях точного учета убытков организаций железнодорожного транспорта от льготного проезда определенных категорий граждан для получения соответствующих компенсаций из бюджетов и соответствует проводимой Правительством Российской Федерации политике, направленной на переход к адресной дотации льгот.

Федеральный закон закрепляет ряд дополнительных правомочий пассажиров, грузоотправителей (отправителей), грузополучателей (получателей) при пользовании ими услугами железнодорожного транспорта. В частности, закрепляется их право на получение необходимой информации о субъектах рынка железнодорожных перевозок (пункт 5 статьи 14), на участие в подготовке графиков движения поездов (пункт 1 статьи 18).

В целях обеспечения согласованности работы всех инфраструктур в Российской Федерации Федеральным законом (статья 18) предусматривается наличие сводного графика движения поездов, утвержденного в порядке, определяемом МПС России, на основании предложенных владельцами инфраструктур графиков движения поездов в пределах инфраструктур.