Прием к перевозке подкарантинных грузов, направляемых на экспорт без перегрузки их на пограничных передаточных станциях в пунктах пропуска через государственную границу, допускается при условии предъявления грузоотправителем вместе с накладной фитосанитарного сертификата, выдаваемого органами Госинспекции по карантину растений в местах отгрузки на каждый вагон, контейнер или на каждую отправку (партию) подкарантинного груза. При приеме к перевозке подкарантинных грузов, направляемых на экспорт с перегрузкой вагонов на пограничных передаточных станциях и в портах, в пунктах пропуска через государственную границу грузоотправитель предъявляет фитосанитарный сертификат.

Фитосанитарный сертификат -документ строгой отчетности, который прикладывается к перевозочным документам при перевозке подкарантинных грузов в международном сообщении. Сертификат является разрешением на перевозку подкарантинного груза и удостоверяет, что груз признан свободным от карантинных объектов, а фитосанитарное состояние его соответствует условиям, указанным в импортном карантинном разрешении; выдается государственными организациями по карантину и защите растений стран-экспортеров. Фитосанитарный сертификат, выдаваемый Госинспекцией по карантину растений Российской Федерации в местах отгрузки подкарантинных грузов, заполняется на двух языках (русском и английском), подписывается госинспектором по карантину растений и заверяется печатью инспекции.

Ввоз в Российскую Федерацию импортных подкарантинных грузов допускается только при наличии на пограничных пунктах пропуска через государственную границу импортного карантинного разрешения (ИКР) и приложенного к накладной СМГС фитосанитарного сертификата государства-экспортера.