СФТО гарантирует от имени железной дороги обеспечение надлежащего выполнения заказов; своевременность доставки грузов; сохранность перевозимых грузов; выполнение услуг в соответствии с условиями заключенных контрактов (договоров).

Основные задачи ЦФТО МПС России -организация совместно с причастными департаментами, управлениями МПС России и железными дорогами комплексного транспортного обслуживания пользователей услуг федерального железнодорожного транспорта (от приема заявки на перевозку до выдачи груза). При этом предусматривается повышение доходности федерального ж.-д. транспорта от выполнения перевозок грузов и оказания других услуг; организация маркетинга на российском и международном рынках с целью изыскания и привлечения грузов на федеральный железнодорожный транспорт; обеспечение полноты и своевременности расчетов с пользователями услуг федерального железнодорожного транспорта за перевозки грузов; координация работы СФТО по организации, предоставлению и расширению перечня предоставляемых услуг в международном и внутреннем железнодорожных сообщениях.

Основные функции ЦФТО МПС России. В области транспортного обслуживания пользователей услуг федерального ж.-д. транспорта система выполняет комплексное предоставление услуг пользователям же лезнодорожного транспорта; сбор, обработку, рассмотрение и согласование заявок на перевозку грузов в международном и внутреннем железнодорожных сообщениях; контроль и анализ выполнения заключенных договоров (контрактов, соглашений) и принятых заявок на перевозку грузов, предоставление результатов контроля причастным департаментам и управлениям МПС России; разрабатывает примерные формы договоров (контрактов, соглашений) с грузоотправителями и экспедиторскими организациями; координирует и реализует договорную работу на организацию перевозок грузов, комплексное транспортное и информационное обслуживание пользователей услуг федерального железнодорожного транспорта, в т. ч. с использованием электронного документооборота. К функциям системы относится: подготовка предложений по ценовой политике на информационные и дополнительные услуги, участие в их согласовании; контроль за выполнением структурными подразделениями системы договоров (контрактов, соглашений), правил, инструкций, других нормативных актов; ведение справочника исключительных тарифов, действующих в рамках реализации гибкой тарифной политики.