Балансовая стоимость указанных в сводном передаточном акте активов учитывается при определении размера уставного капитала ОАО РЖД. Согласно пункту 3 статьи 4 Федерального закона размер уставного капитала не может быть выше этой балансовой стоимости. Такая конструкция обусловлена рядом причин. Во-первых, в условиях, когда у акционерного общества имеется единственный учредитель, а акции этого общества не могут быть каким-либо образом отчуждены, не имеет никакого смысла проводить предусмотренную законодательством об оценочной деятельности независимую оценку вносимого в уставный капитал имущества, которая потребует существенных расходов из федерального бюджета или повышения тарифов на перевозки. Во-вторых, размер уставного капитала должен быть ниже балансовой стоимости вносимого в уставный капитал имущества для того, чтобы создать необходимый резерв в случае уменьшения чистых активов акционерного общества, особенно в начальный период его функционирования. Это позволит избежать крайне нежелательных последствий (например, уведомление кредиторов, возмещение причиненных им убытков), возникающих в случае уменьшения уставного капитала акционерного общества, когда размер чистых активов общества окажется ниже размера его уставного капитала. Сводным передаточным актом также определяется состав имущества, подлежащего внесению в уставный капитал ОАО РЖД. На основании сводного передаточного акта производится государственная регистрация права собственности ОАО РЖД на вносимое в его уставный капитал недвижимое имущество.

Одним из важнейших вопросов является вопрос о собственности на земли железнодорожного транспорта. Пунктом 3 статьи 4 Федерального закона предусмотрено, что земли железнодорожного транспорта, в частности, находящиеся под магистральными железнодорожными линиями, станциями, вокзалами, объектами мобилизационного назначения и гражданской обороны, а также под имуществом, обеспечивающим выполнение аварийновосстановительных работ, сохраняются в федеральной собственности. Такие земли, прежде всего, имеют стратегическое назначение, не могут быть приватизированы, поэтому предоставляются ОАО РЖД в аренду по льготной ставке - в размере до 25 процентов от ставки земельного налога, установленной за сельскохозяйственные угодья согласно Закону Российской Федерации «О плате за землю». Земли, находящиеся под предприятиями потенциально-конкурентного сектора (ремонтные мастерские, строительные участки и др.), социальной сферы, могут подлежать приватизации. Такое решение вопроса удовлетворяет интересам как с позиции национальной безопасности, обороноспособности государства, так и с позиции повышения инвестиционной привлекательности предприятий отрасли.