В случае отсутствия контроля операций с заработной платой могут быть случаи завышения начисленных сумм, выплаты подставным лицам, а также возможны злоупотребления при выдаче денег. Их можно предотвратить, если сверять основания с начисленными суммами, подписывать ведомость к оплате после полного ее заполнения с указанием общего итога выплачиваемых средств. Кроме того, многие возможности хищений аннулируются при назначении кассиром не бухгалтера, а также внезапная ревизия кассы. Контроль платежных поручений на перечисления средств заработной платы на счета в банк предотвращает незаконные перечисления, при этом просматриваются основания, сверяются их суммы.

Контроль расчетов по заработной плате следует начинать с проверки расчетно-платежной ведомости (первичный документ), которая подписывается руководителем до выдачи причитающихся средств. При этом начисленные суммы по каждому работнику должны соответствовать суммам трудовых соглашений, договоров подряда, а также окладам согласно штатному расписанию или ставкам, установленным для повременщиков. Проверяются суммы удержаний, их основания, итоги средств, подлежащих выплате. Руководитель должен знать, что удержание подоходного налога обязательно у всех работающих на предприятии, в том числе у лиц, выполняющих работы по договорам подряда и другим договорам гражданско-правового характера.

Обязательным является и сообщение о полученных средствах в налоговую инспекцию по месту прописки работника для его правильного налогообложения. Общие суммы выплачиваемых средств должны совпадать с итогом, отраженным по всей ведомости и утвержденным руководителем. Итог суммы, подлежащей выплате по всем ведомостям На какую-то дату должен соответствовать сумме данного приходного кассового ордера, а сумма выплаченных средств (отраженная в конце ведомости) - сумме расходного кассового ордера.